Ендометріоїдниє цістаденокарціноми менш кістозна, ніж серозні або муцинозні. Їх розміри варіюють від 2 до 35 см, в основному — близько 10-20 см в діаметрі.

Макроскопічно забарвлення їх коричнева або червонувата. У просвіті кіст — вміст аналогічного виду. Солідні вузли мають строкатий вигляд, з крововиливами. Середній вік хворих становить 50 років. У черевній порожнині можуть бути виявлені асцит, множинні імплантаційні метастази, хоча в цілому метастази при ендометріоїдних раку зустрічаються рідше, ніж при серозному.

Мікроскопічно епітеліальні клітини ендометріоїдної аденокарциноми кубічної або циліндричної форми, світлі, мономорфні з округлими ядрами, наявністю глікогену. Вії не виявляються. Клітини ендометріоїдних пухлин можуть продукувати муцин, переважно позаклітинний. Характерною ознакою цієї пухлини є плоскоклеточная метаплазия. Більшість цих пухлин виникає як плоскоклеточная карцинома.

Рак з ендометріоїдних кісти виникає в 5-10% випадків. Атипические гиперпластические зміни в ендометріозі яєчників можуть бути передвісником ендометріоїдних карцином. Виникнення останніх можливо з раніше існуючих цістаденом або аденофібром. При цьому рак яєчників в 4% випадків поєднується з карциномою ендометрію. У таких хворих важко визначити, чи є первинною одна з пухлин або обидві.