Різні відділи кишечника людини характеризуються наявністю оптимальної кількості певних видів бактерій. Їх взаємодія один з одним дозволяє організму підтримувати імунітет на високому рівні, забезпечує травлення і синтез вітамінів групи В. Під впливом різних факторів природне співвідношення корисних мікроорганізмів в кишечнику людини порушується. Крім того, можуть з'явитися деякі патогенні бактерії і грибки. Цей стан називається дисбактеріозом.
Причин виникнення дисбактеріозу багато, а його симптоми досить неоднозначні. Визначити діагноз і подальше лікування допомагає аналіз калу. Це вивчення мікрофлори кишечника, яке показує співвідношення різних типів бактерій в калі людини: корисних, патогенних і умовно-патогенних. Аналіз виявить, яким чином порушений природний баланс мікрофлори і не з'явилися в ній бактерії і грибки, яких бути не повинно (синьогнійна паличка, кандида, протей). Найчастіше цей аналіз виконується бактеріологічним методом, іноді — біохімічним.
Показання до призначення аналізу
Основними симптомами, які супроводжують дисбактеріоз, є порушення стільця, метеоризм і болі в животі. Але передумови для перевірки кишкової мікрофлори розрізняються залежно від віку людини. Так, для новонароджених це:
- вагіноз матері, викликаний бактеріями;
 - застій грудного молока і розвиток запалення молочних залоз у матері;
 - пізнє прикладання до грудей , непереносимість материнського молока;
 - низькі бали за шкалою Апгар;
 - реанімація після пологів;
 - пізня виписка з пологового будинку, що сприяє потраплянню мікроорганізмів з навколишнього середовища в кишечник новонародженого;
 - незрілість кишечника;
 - первинний імунодефіцит;
 - синдром мальабсорбції;
 - гнійні інфекції.
 
У перші роки життя дитини важливо враховувати:
- проблеми в період новонародженості;
 - харчування сумішами з раннього віку;
 - рахіт;
 - часті респіраторні вірусні захворювання;
 - анемію;
 - гипотрофию;
 - алергічний дерматит;
 - неврологічні порушення.
 
 У дитячому і підлітковому віці крім порушень травлення важливо звертати увагу на частоту простудних захворювань, викликаних вірусними інфекціями, і алергічних проявів. Наркоманія також може бути показанням до того, щоб досліджувати кал на дисбактеріоз. 
  Дорослим і літнім людям слід мати на увазі: 
- шкідливість умов праці;
 - стрес ;
 - неправильні харчові звички;
 - інфекційні захворювання кишечника;
 - прийом антибіотиків, гормонів, нестероїдних протизапальних препаратів;
 - імунодефіцит;
 - хіміотерапевтичні процедури;
 - вікові зміни в складі мікрофлори.