Заміщення здійснюється в результаті регенерації і епідермізаціі. При регенерації заміщення відбувається від периферії ектопії до отвору матки з базального зародкового шару багатошарового плоского епітелію. Плоский епітелій росте під циліндричним епітелієм, витісняючи його, або перекриває його у вигляді окремих «мов» різної ширини. Спочатку плоский епітелій складається з базального і парабазальних шарів, потім кількість шарів збільшується, і він стає багатошаровим.

Основне значення в заміщенні циліндричного епітелію ектопії має епідермізаціі. При епідермізаціі багатошаровий плоский епітелій утворюється за рахунок трансформації (проліферації) дрібних резервних клітин циліндричного епітелію, розташованих між базальноїмембраною і циліндричним епітелієм ектопії. Резервні клітини циліндричного епітелію під впливом кислого середовища піхви втрачають свою секреторну активність і перетворюються в недиференційований регенеративний епітелій, т. Е. В подальшому відбувається метаплазія недиференційованого епітелію в багатошаровий плоский. Процеси регенерації і епідермізаціі дуже тривалі, іноді тривають кілька років. У більшості випадків заміщення циліндричного епітелію ектопії багатошаровим плоским епітелієм — доброякісний процес.

Макроскопічно при епідермізаціі ектопірованного циліндричного епітелію спостерігається збліднення його поверхні. Навколо отвору матки визначаються червоні плями різної форми і величини з матовою поверхнею і розпливчастими обрисами. На тлі червоних плям або дифузною гіперемії видно жовтуваті зернятка ретенційних кіст (ovulae Nabothi). Розвиток ретенційних кіст пов'язано з особливостями епідермізаціі залізистих ходів циліндричного епітелію. Залізисті ходи поступово розтягуються скупчуються секретом циліндричного епітелію з утворенням ретенційних кіст. Кольпоскопическая картина зони перетворення дуже різноманітна. У стадії регенерації епітелію видно «мови» багатошарового плоского епітелію, «наповзає» на циліндричний епітелій ектопії від периферії до отвору матки. Перекриті плоским епітелієм залози, наповнені слизом, мають вигляд жовтуватих вибухаючої горбків на тлі рожевого плоского епітелію. 

«Закриті» залози мають різну величину і іноді добре видно неозброєним оком. На їх поверхні кольпоскопически зазвичай визначаються розтягнуті древовидно розгалужені кровоносні судини.

При гістологічному дослідженні поверхню слизової оболонки зони перетворення покрита багатошаровим плоским епітелієм. У подепітеліальной тканини видно численні розширені залози, заповнені секретом.