Збудники інфекції шлунково-кишкового тракту

• Бактерії , наприклад, Е. coli 0157: Н7, Shigella sp., Salmonella sp., Campylobacter sp., Listeria mono-cylogenes, Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae, V. parahaemolyticus, C. difficile (більшість нозокоміальних колітів після прийому антибіотиків, які ушкоджують кишкову флору), С. perfringens типу A, S. aureus, В. cereus.
• Віруси, наприклад аденовірус, цитомегаловірус, норовірус, ротавірус (асімптоматічнимі протікають тільки у дітей і підлітків), Астровіруси, ВІЛ.
• протозойними інфекція (наприклад, мікроспорія, Entamoeba histolytica, Giardia lamblia, Balanyidium coli, Cryptosporidium spp., Isospora belli).
• Гельмінти (наприклад, Diphyllobothrium latum, Echinococcus granulosus і multilocularis, Taenia saginata і solium, Ascaris lumbricoides, Enterobius uermicularis).