При повній вираженості синдрому пацієнти зазвичай сприйнятливі до опортуністичних інфекцій, і можливий летальний результат при переливанні крові внаслідок реакції «трансплантат проти господаря».
при частковому синдромі Діджорджіо з варіабельною гіпоплазією розвиток і відповідь на інфекцію можуть бути адекватними.
Тимус часто відсутня, при ектопії тимуса гістологія в нормі.
При гіпоплазії тимуса фолікули лімфатичних вузлів в нормі, але в паракортикальній і тімусзавісімих зонах спостерігаються ділянки клітинного виснаження. Ризик розвитку раку і аутоімунних захворювань при гіпоплазії тимуса — синдрому Діджорджіо не підвищений.