При огляді неозброєним оком ділянки ектопії представляються у вигляді піднесених над слизовою оболонкою асиметричних плям яскраво-червоного кольору з зернистою поверхнею. За розміром і формою ектопія може бути кільцеподібної форми, у вигляді облямівки різної ширини навколо отвору матки або займати більшу частину передньої або задньої губи навколо отвору матки. При огляді шийки матки за допомогою дзеркал яскраво-червоні оксамитові ділянки ектопії в ряді випадків видаються підозрілими на злокачественно переродження, при дотику легко кровоточать.
Кольпоскопическая картина ектопії дуже характерна. За кольором і рельєфом поверхні ектопія різко відрізняється від слизової оболонки, покритої багатошаровим плоским епітелієм. Вона має вигляд гроздевідних скупчень дрібних кулястих або довгастих сосочків яскраво-червоного кольору. Колір ектопії обумовлений тим, що крізь одношаровий циліндричний епітелій, що покриває сосочки, добре просвічують кровоносні судини. Сосочки легко ранимі і при незначній травмі кровоточать. Кордон циліндричного і плоского епітелію зміщується на вагінальну частину шийки матки.
Під час гістологічного дослідження ектопічних ділянок виявляється железістопапіллярная псевдоерозія.