Початок хвороби часто пов'язують з вдиханням елементів грибів, в подальшому розвиваються микотический бронхіт, рідше пневмонія ( «логічний мукороз»). При пневмомикозов на розтині виявляли великі казеозние ділянки, навколо яких спостерігалося розростання фіброзної тканини. У процес втягуються також лімфатичні вузли, плевра, іноді діафрагма. Мікроскопічно : вогнища ураження представлені некротизованої тканиною, оточені невеликою кількістю паличкоядерних лейкоцитів, плазматичними клітинами і еозинофілами, зустрічаються гігантські клітини. У некротизованої тканини, а часто і в гігантських клітинах виявляються великі розгалужені нитки міцелію гриба.
Крім змін в дихальному тракті, як і при аспергиллезе, спостерігаються ураження області очної орбіти, придаткових пазух з наступним проростанням гриба в порожнину черепа, що може викликати ураження оболонок і речовини головного мозку (в повному сенсі цього поняття — «людина проплесневел» ). Розвиток мукоромікотіческого менінгіту можливо і в результаті занесення гриба при спинномозковій пункції. Описано також мукорозние ураження шлунка, кишечника ( «гастроінтестинальний мукороз»), нирок. Проростаючи стінки артерій, вен і лімфатичних судин, міцелій гриба утворює «сплетіння» в їх просвіті, в результаті чого розвиваються тромбози і інфаркти. При генералізації процесу перебіг захворювання приймає бурхливий характер і швидко закінчується смертю. Метастатичні вогнища при генералізованому мукорози виявляються у внутрішніх органах і в головному мозку.
До рідкісних проявів відносять мукороз шкіри (з почервонінням, ущільненням її, некрозом і формуванням виразок з чорними корками). Пліснява можуть ускладнювати різні травми, рани, опікові поверхні, трофічні виразки, що значно обтяжує їх перебіг.
У зрізах тканини збудник мукорози виявляється у вигляді несептірованного широкого міцелію товщиною від 4 до 20 мкм. Іноді на кінцях міцелію видно кулясті потовщення, заповнені спорами (спорангіями). При фарбуванні зрізів тканини гематоксілінеозіном стінки міцелію і спор фарбуються гематоксиліном, а протоплазма — еозином. Чіткіше гриби контурируются при докраске фону тіоніном. Для остаточного діагнозу необхідно мікроскопічне вивчення мазків-відбитків і виділення гриба в чистій культурі. Тканинна реакція при мукорози подібна зі змінами при аспергиллезе. На відміну від аспергилл, міцелій мукор значно товщі і не септірованного. Однак, незважаючи на ці відмінності, провідна роль в ідентифікації мукорозних грибів належить методу виділення їх в чистій культурі. У ряді випадків ураження при мукорози можуть поєднуватися з процесами, викликаними іншими пліснявими або дріжджоподібними грибами.